
一、基因敲降的前期準(zhǔn)備工作相同1.1?生物信息學(xué)分析目標(biāo)基因在斑馬魚早期胚胎發(fā)送過程中是否有表達。1.2?收集斑馬魚早期發(fā)育胚胎(通常為48?hpf?前的胚胎),提取總RNA,然后進行體外轉(zhuǎn)錄(RT)。1.3?設(shè)計檢測目標(biāo)基因表達的PCR?引物,以1.2獲得的cDNA?為模板,進行PCR?擴增,確認目標(biāo)基因在早期有表達。二、MO法與CRISPRi法的敲降原理不同2.1?MO?是在轉(zhuǎn)錄后水平上敲降基
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一般推薦MO+CRISPRi兩種策略去同時敲降一個基因,由于MO是在轉(zhuǎn)錄后水平上敲降基因的功能,而CRISPRi是在轉(zhuǎn)錄水平上敲降基因的功能,使用兩種獨立的、原理完全不同的敲降方法,如果給出的敲降效果(表型)是一樣的,那么這樣建立的敲降方法可以被認可是有效且特異的。請大家注意:評價基因敲降效果需要從有效和特異兩個方面來考慮。有效性問題:CRISPRi敲降的有效性可以通過RT-PCR法檢測目標(biāo)基因表
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